Conway zette bij de start een 1.56.172 neer, twee seconde sneller dan de beste tijd van Fernando Alonso in de eerste sessie. Kazuki Nakajima, die de ander Toyota met Alonso deelt, eindigde als tweede.

Toyota was vlot 2,6 seconde sneller dan de eerste privé-LMP1, de BR01 van DragonSpeed. Pietro Fittipaldi klokte met de bolide een 1.58.835. Rebellion werd vierde en vijfde met de R-13's van Gustavo Menezes en Neel Jani. De twee BR01-bolides van SMP Racing waren zesde en zevende. SMP-rijder Stéphane Sarrazin veroorzaakte door een uitstapje in het grind van Stavelot voor een eerste rode vlag. Manor kwam andermaal niet verder dan een installatieronde met de nieuwe Ginetta G60-LT-P1-Mecachrome.

Pastor Maldonado was opnieuw de snelste in LMP2 met de DragonSpeed Oreca-Gibson 07. Zijn tijd van 2.02.991 was drie tiende rapper dan de tijd van Nabil Jeffri in de Jackie Chan DC Racing Oreca. Matthieu Vaxiviere veroorzaakte de tweede rode vlag door van de baan te gaan bij Malmedy in de TDS Oreca. Racing Team Nederland was zevende in klasse op drie seconden van de leiders, maar volgde in de eerste training goed het tempo van de concurrentie.

Ford-team Ganassi voerde ook in de tweede sessie de GTE Pro aan, dit keer met Stefan Mücke. Gianmaria Bruni was bijna een seconde trager in de eerste Porsche 911 RSR, gevolgd door de tweede wagen van Ford en Porsche. James Calado klokte de vijfde tijd in de AF Corse Ferrari 488 GTE #51, gevolgd door de eerste Aston Martin. De BMW's van onder andere Nick Catsburg waren de traagste wagens in de klasse.

Ben Barker was de rapste in GTE Am met de Gulf Racing Porsche, nipt sneller dan de Proton Porsche #77 die de eerste training aan de leiding ging.

WEC 6 Uur Spa: Vrije training 2

Pos	#	Coureurs	Auto	Klasse	Ronden	Tijd	Interval	Verschil	Km/u
1	7	Kamui Kobayashi Mike Conway Jose Maria Lopez	Toyota TS050 Hybrid	LMP1	29	1'56.172			217.043
2	8	Fernando Alonso Kazuki Nakajima Sébastien Buemi	Toyota TS050 Hybrid	LMP1	33	1'56.815	0.643	0.643	215.848
3	10	Henrik Hedman Ben Hanley Pietro Fittipaldi	BR Engineering BR1 - Gibson	LMP1	24	1'58.835	2.663	2.020	212.179
4	3	Mathias Beche Thomas Laurent Gustavo Menezes	Rebellion R13 - Gibson	LMP1	30	1'59.011	2.839	0.176	211.866
5	1	Andre Lotterer Bruno Senna Neel Jani	Rebellion R13 - Gibson	LMP1	24	1'59.580	3.408	0.569	210.858
6	17	Stéphane Sarrazin Matevos Isaakyan Egor Orudzhev	BR Engineering BR1 - AER	LMP1	23	2'00.035	3.863	0.455	210.058
7	11	Vitaly Petrov Mikhail Aleshin	BR Engineering BR1 - AER	LMP1	27	2'00.192	4.020	0.157	209.784
8	4	Oliver Webb Dominik Kraihamer Tom Dillmann	ENSO CLM P1/01 - Nismo	LMP1	16	2'01.466	5.294	1.274	207.584
9	31	Pastor Maldonado Nathanael Berthon Roberto Gonzalez	Oreca 07 - Gibson	LMP2	31	2'02.991	6.819	1.525	205.010
10	37	Nabil Jeffri Weiron Tan Jazeman Jaafar	Oreca 07 - Gibson	LMP2	29	2'03.306	7.134	0.315	204.486
11	26	Jean-Eric Vergne Roman Rusinov Andrea Pizzitola	Oreca 07 - Gibson	LMP2	28	2'03.594	7.422	0.288	204.009
12	50	Fernando Rees Romano Ricci Erwin Creed	Ligier JSP217 - Gibson	LMP2	17	2'03.881	7.709	0.287	203.537
13	38	Ho-Pin Tung Stéphane Richelmi Gabriel Aubry	Oreca 07 - Gibson	LMP2	27	2'04.279	8.107	0.398	202.885
14	36	Nicolas Lapierre Pierre Thiriet André Negrao	Alpine A470 - Gibson	LMP2	30	2'05.296	9.124	1.017	201.238
15	29	Jan Lammers Giedo van der Garde Frits van Eerd	Dallara P217 - Gibson	LMP2	30	2'05.973	9.801	0.677	200.157
16	28	Loic Duval François Perrodo Matthieu Vaxivière	Oreca 07 - Gibson	LMP2	12	2'06.734	10.562	0.761	198.955
17	66	Stefan Mücke Olivier Pla Billy Johnson	Ford GT	LMGTE PRO	16	2'13.733	17.561	6.999	188.542
18	91	Gianmaria Bruni Richard Lietz	Porsche 911 RSR	LMGTE PRO	31	2'14.647	18.475	0.914	187.262
19	67	Harry Tincknell Tony Kanaan Andy Priaulx	Ford GT	LMGTE PRO	29	2'14.706	18.534	0.059	187.180
20	92	Michael Christensen Kevin Estre	Porsche 911 RSR	LMGTE PRO	31	2'15.183	19.011	0.477	186.520
21	51	James Calado Alessandro Pier Guidi	Ferrari 488 GTE EVO	LMGTE PRO	30	2'15.516	19.344	0.333	186.062
22	95	Marco Sorensen Nicki Thiim Darren Turner	Aston Martin Vantage AMR	LMGTE PRO	23	2'15.564	19.392	0.048	185.996
23	71	Sam Bird Davide Rigon	Ferrari 488 GTE EVO	LMGTE PRO	29	2'15.779	19.607	0.215	185.701
24	86	Michael Wainwright Ben Barker Alex Davison	Porsche 911 RSR	LMGTE AM	26	2'16.113	19.941	0.334	185.246
25	97	Jonathan Adam Maxime Martin Alex Lynn	Aston Martin Vantage AMR	LMGTE PRO	25	2'16.182	20.010	0.069	185.152
26	77	Christian Ried Matt Campbell Julien Andlauer	Porsche 911 RSR	LMGTE AM	28	2'16.434	20.262	0.252	184.810
27	82	Antonio Felix da Costa Tom Blomqvist	BMW M8 GTE	LMGTE PRO	28	2'16.782	20.610	0.348	184.340
28	98	Pedro Lamy Paul Dalla Lana Mathias Lauda	Aston Martin Vantage	LMGTE AM	28	2'16.790	20.618	0.008	184.329
29	54	Giancarlo Fisichella Francesco Castellacci Thomas Flohr	Ferrari 488 GTE	LMGTE AM	29	2'16.897	20.725	0.107	184.185
30	88	Khaled Al Qubaisi Matteo Cairoli Giorgio Roda	Porsche 911 RSR	LMGTE AM	29	2'17.057	20.885	0.160	183.970
31	81	Nick Catsburg Martin Tomczyk	BMW M8 GTE	LMGTE PRO	30	2'17.100	20.928	0.043	183.912
32	90	Salih Yoluc Euan Hankey Charlie Eastwood	Aston Martin Vantage	LMGTE AM	24	2'17.229	21.057	0.129	183.739
33	56	Jörg Bergmeister Patrick Lindsey Egidio Perfetti	Porsche 911 RSR	LMGTE AM	29	2'17.377	21.205	0.148	183.541
34	61	Matt Griffin Mok Weng Sun Keita Sawa	Ferrari 488 GTE	LMGTE AM	29	2'17.552	21.380	0.175	183.308
35	70	Olivier Beretta Eddie Cheever III Motoaki Ishikawa	Ferrari 488 GTE	LMGTE AM	29	2'18.340	22.168	0.788	182.263