Iannone verbrak al vroeg in de sessie de scherpe tijd van Jorge Lorenzo een dag eerder. En ook al leek Iannone kwetsbaar aan de kop van de tijdenlijst, hij bleef bovenaan. Marquez kwam uiteindelijk het dichtst bij de Italiaan op slechts 0,013 seconde.

Maverick Viñales was ook rap onderweg, maar de Suzuki-rijder kwam in het laatste deel van zijn ronde iets tekort. Pramac Ducati-rijder Scott Redding nam vervolgens de derde plaats over van Viñales en was slechts een tiende langzamer dan Iannone.

Achter Viñales zorgde Andrea Dovizioso ervoor dat drie Ducati’s in de topvijf eindigden. Wel moest hij drie tienden van een seconde toegeven op zijn merkgenoot. Dani Pedrosa maakte de topvijf met de Repsol Honda compleet en Valentino Rossi verbeterde op het laatste moment naar plek zeven. Hij was de beste Yahama-fabriekscoureur.

Lorenzo eindigde als negende op een halve seconde van Iannone en slechts 0,051 seconde op Rossi, een plaats achter de Avintia Ducati van Hector Barbera. Danilo Petrucci, die herstelt van een fractuur in zijn hand en de pre-season test op Qatar moest missen, maakte de toptien compleet.

LCR Honda-rijder Cal Crutchlow en Avintia’s Loris Baz waren de enige twee rijders die vielen.

Uitslag: MotoGP 2016 Qatar GP VT2

Pos	Rijder	Motor	Tijd	Verschil
1	Andrea Iannone	Ducati GP16	1:55.388
2	Marc Marquez	Honda RC213V	1:55.401	+0.013
3	Scott Redding	Ducati GP15	1:55.511	+0.123
4	Maverick Viñales	Suzuki GSX-RR	1:55.644	+0.256
5	Andrea Dovizioso	Ducati GP16	1:55.721	+0.333
6	Dani Pedrosa	Honda RC213V	1:55.764	+0.376
7	Valentino Rossi	Yamaha YZR-M1	1:55.883	+0.495
8	Hector Barbera	Ducati GP14	1:55.919	+0.531
9	Jorge Lorenzo	Yamaha YZR-M1	1:55.934	+0.546
10	Danilo Petrucci	Ducati GP15	1:56.258	+0.870
11	Aleix Espargaro	Suzuki GSX-RR	1:56.293	+0.905
12	Pol Espargaro	Yamaha YZR-M1	1:56.324	+0.936
13	Cal Crutchlow	Honda RC213V	1:56.489	+1.101
14	Yonny Hernandez	Ducati GP14	1:56.558	+1.170
15	Loris Baz	Ducati GP14	1:56.623	+1.235
16	Bradley Smith	Yamaha YZR-M1	1:56.728	+1.340
17	Jack Miller	Honda RC213V	1:56.900	+1.512
18	Alvaro Bautista	Aprilia RS-GP	1:57.012	+1.624
19	Tito Rabat	Honda RC213V	1:57.429	+2.041
20	Stefan Bradl	Aprilia RS-GP	1:57.541	+2.153
21	Eugene Laverty	Ducati GP14	1:57.722	+2.334