Lorenzo liet de klok in de tweede oefensessie stilstaan na 1.20.885 en werkte zichzelf daarmee naar de eerste plaats in de tijdenlijst. Marc Marquez stond lange tijd op de eerste positie. De regerend wereldkampioen ging in de openingsfase naar een 1.21.349, maar wist zich daarna niet meer te verbeteren.

Marquez, bijgenaamd ‘The King of The Ring’ omdat hij in zijn laatste acht deelnames op de Sachsenring telkens wist te winnen (2010: 125c, 2011-2012: Moto2 en 2013-2017: MotoGP), viel daardoor terug naar de vijfde positie. In de eerste bocht botste Marquez nog bijna met Johann Zarco, nadat eerstgenoemde zich verremde. De twee bleven echter overeind en konden hun weg vervolgen.

Danilo Petrucci eindigde als tweede, op 0,257 seconde van Lorenzo. Andrea Iannone, in de ochtend nog de snelste met een 1.21.442, gaf 0,319 seconde toe op de snelste man en werd zodoende derde. Ook Andrea Dovizioso (+0,424) wist Marquez voor te blijven op het korte baantje in de deelstaat Saksen. Maverick Viñales, Takaaki Nakagami, Jack Miller, Cal Crutchlow en Alvaro Bautista completeerden de top-tien. De tien snelste mannen in FP2 zijn voorlopig ook verzekerd van rechtstreekse deelname aan Q3.

Op 0,899 seconde van Lorenzo moest Valentino Rossi genoegen nemen met de zeventiende tijd. Zarco en Dani Pedrosa, die donderdag bekendmaakte na dit seizoen met pensioen te gaan, konden met respectievelijk P18 en P20 evenmin imponeren. Op dit moment zijn zij veroordeeld tot deelname aan het eerste kwalificatiesegment. Thuisrijder Stefan Bradl, die plaatsneemt op de motor bij Marc VDS nadat Franco Morbidelli na de eerste oefensessie alsnog geblesseerd afhaakte, besloot FP2 als 21ste.

Na ongeveer tien minuten in de sessie beleefde Mika Kallio een zware crash. De Finse rijder van KTM, met een wildcard toegelaten tot het evenement, ging wijd in bocht 8 en klapte vervolgens in de baanafzetting. Kallio was na de klap bij bewustzijn, maar is wel ter controle overgebracht naar het medisch centrum. Hij besloot de sessie als 24ste, voor hekkensluiter Xavier Simeon. De Belg, die ten val kwam in bocht 3, gaf 2,5 seconde toe op Lorenzo.

MotoGP 2018 Grand Prix van Duitsland, uitslag tweede vrije training:

Pos	#	Rijder	Motor	Ronden	Tijd	+
1	99	Jorge Lorenzo	Ducati	22	1'20.885
2	9	Danilo Petrucci	Ducati	22	1'21.142	0.257
3	29	Andrea Iannone	Suzuki	21	1'21.204	0.319
4	4	Andrea Dovizioso	Ducati	22	1'21.309	0.424
5	93	Marc Marquez	Honda	27	1'21.349	0.464
6	25	Maverick Viñales	Yamaha	22	1'21.384	0.499
7	30	Takaaki Nakagami	Honda	26	1'21.447	0.562
8	43	Jack Miller	Ducati	23	1'21.497	0.612
9	35	Cal Crutchlow	Honda	23	1'21.540	0.655
10	19	Alvaro Bautista	Ducati	25	1'21.568	0.683
11	42	Alex Rins	Suzuki	24	1'21.616	0.731
12	44	Pol Espargaro	KTM	21	1'21.680	0.795
13	41	Aleix Espargaro	Aprilia	25	1'21.718	0.833
14	38	Bradley Smith	KTM	23	1'21.743	0.858
15	53	Tito Rabat	Ducati	23	1'21.777	0.892
16	55	Hafizh Syahrin	Yamaha	22	1'21.777	0.892
17	46	Valentino Rossi	Yamaha	23	1'21.784	0.899
18	5	Johann Zarco	Yamaha	23	1'21.787	0.902
19	45	Scott Redding	Aprilia	22	1'22.003	1.118
20	26	Dani Pedrosa	Honda	25	1'22.305	1.420
21	6	Stefan Bradl	Honda	22	1'22.457	1.572
22	17	Karel Abraham	Ducati	22	1'22.555	1.670
23	12	Thomas Luthi	Honda	23	1'22.767	1.882
24	36	Mika Kallio	KTM	5	1'23.194	2.309
25	10	Xavier Simeon	Ducati	19	1'23.437	2.552