Jorge Martin wist bij de start van de achttien ronden tellende wedstrijd (droog, 22 graden) zijn eerste pole-position te verzilveren. De Spanjaard pakte bij het ingaan van de eerste bocht de leiding voor Philipp Oettl (KTM), Niccolo Antonelli (KTM), Joan Mir (Honda) en de van P4 vertrokken Bendsneyder (KTM). Romano Fenati (Honda), derde op de grid, kende een slecht begin. De Italiaan viel terug naar de achtste positie.

Vooraan ontstond gelijk een kopgroep van zo'n vijftien piloten. De volgorde wisselde elke ronde op het lange rechte stuk van Losail waar fanatiek elkaars kielzog werd opgezocht. Zeker Bendsneyder had het met zijn lengte daar moeilijk. De Nederland viel bij de eerste doorkomst terug van de vijfde naar de elfde plaats.

Crash Bendsneyder

In het middenveld ging het in de vierde ronde mis voor Bendsneyder, die in Bocht 6 werd aangetikt door een te laat remmende Livio Loi (Honda) - gestart vanaf P18 - en ten val kwam. Hinkend met zijn linkervoet wist Bendsneyder weer op de motor te stappen en zijn weg te vervolgen. Maar een goede uitslag zat er met een dertigste plaats op achttien seconden van de voorlaatste rijder niet meer in. De Rotterdammer volbracht de wedstrijd op de 26e en laatste plaats.

Aan kop was het klassiek Moto3-racen met drie, vier rijders naast elkaar tijdens het slipstreamen. Juanfran Guevara (KTM) en Oettl verlieten in de dertiende ronde het strijdtoneel door een crash. Daarmee dunde de leidende groep uit naar elf rijders.

In de slotfase moesten Adam Norrodin (Honda) en Ayumu Sasaki (Honda) een jasje uitdoen. Beide Aziaten konden het hoge tempo niet meer volgen, waardoor de strijd voor de winst een affaire werd tussen negen coureurs: Martin, Mir, Antonelli, Fabio di Gianantonio (Honda), Fenati, Aron Canet (Honda), John McPhee (Honda), Marcos Ramirez (KTM) en Andrea Migno (KTM).

Mir, beste nieuwkomer in 2016, ging als eerste de slotronde in, gevolgd door McPhee. De Schot wist de Spanjaard te verschalken, maar werd even later weer teruggepakt. Het lukte Mir om tot de finishstreep het gat dicht te houden. Ook McPhee liet er niemand meer langs en finishte op 0.135 van Mir als tweede. De derde en laatste podiumplek ging naar Martin.

Vier punten voor Loi

Canet arriveerde als vierde, voor Fenati, Migno, Antonelli en Di Gianantonio. Ramirez haakte wat af in de laatste ronde. Hij kwam als negende binnen. Zes seconden achter de Spanjaard werd Norrodin tiende. 

Loi wist een spannende strijd voor de twaalfde plek te winnen. De Belg klopte vier achtervolgers met miniem verschil. Onder de belagers bevond zich Enea Bastianini (Honda). De WK-tweede van vorig jaar stelde hevig teleur met de zestiende plek. 

Naast Guevara en Oettl wisten ook Albert Arenas (Mahindra) en Patrik Pulkkinen (Peugeot) de eindstreep niet te bereiken.

	Rijder	Motor	Tijd	Interval	Verschil
1	Joan Mir	Honda	38'27.364
2	John McPhee	Honda	38'27.499	0.135	0.135
3	Jorge Martin	Honda	38'27.582	0.218	0.083
4	Aron Canet	Honda	38'27.616	0.252	0.034
5	Romano Fenati	Honda	38'27.817	0.453	0.201
6	Andrea Migno	KTM	38'27.943	0.579	0.126
7	Niccolò Antonelli	KTM	38'28.025	0.661	0.082
8	Fabio Giannantonio	Honda	38'28.242	0.878	0.217
9	Marcos Ramirez	KTM	38'29.057	1.693	0.815
10	Adam Norrodin	Honda	38'35.268	7.904	6.211
11	Ayumu Sasaki	Honda	38'39.585	12.221	4.317
12	Livio Loi	Honda	38'44.112	16.748	4.527
13	Darryn Binder	KTM	38'44.150	16.786	0.038
14	Nicolo Bulega	KTM	38'44.185	16.821	0.035
15	Tatsuki Suzuki	Honda	38'44.196	16.832	0.011
16	Enea Bastianini	Honda	38'44.307	16.943	0.111
17	Jules Danilo	Honda	38'54.947	27.583	10.640
18	Nakarin Atiratphuvapat	Honda	38'55.002	27.638	0.055
19	Kaito Toba	Honda	38'55.005	27.641	0.003
20	Jakub Kornfeil	Peugeot	38'55.398	28.034	0.393
21	Maria Herrera	KTM	38'55.514	28.150	0.116
22	Manuel Pagliani	Mahindra	38'55.743	28.379	0.229
23	Lorenzo dalla Porta	Mahindra	38'55.752	28.388	0.009
24	Tony Arbolino	Honda	38'56.884	29.520	1.132
25	Marco Bezzecchi	Mahindra	39'21.708	54.344	24.824
26	Bo Bendsneyder	KTM	39'37.133	1'09.769	15.425
DNF	Patrik Pulkkinen	Peugeot	31'07.793	4 ronden	4 ronden
DNF	Juanfran Guevara	KTM	25'40.136	6 ronden	2 ronden
DNF	Philipp Oettl	KTM	25'40.454	6 ronden	0.318
DNF	Albert Arenas	Mahindra	8'41.111	14 ronden	8 ronden

WK-stand

De tussenstand in het wereldkampioenschap komt uiteraard overeen met de uitslag van de Grand Prix van Qatar. Mir leidt met 25 punten, voor McPhee (20) en Martin (16). Loi staat twaalfde met vier punten. 

De volgende race is de Grand Prix van Argentinië (Termas de Rio Hondo) op 9 april.