Bastianini (Honda) moet op Misano drie plekken naar achteren starten voor onverantwoord rijgedrag in de kwalificatie op zaterdag. De Italiaan verloor daarmee de pole aan Jorge Martin (Honda) en moet ook Joan Mir (Honda) en Fabio di Giannantonio (Honda) voor zich dulden.

Hij was niet de enige die pech had. Tony Arbolino kreeg dezelfde straf. Voor Niccolo Antonelli (KTM), Andrea Migno (KTM), Ayumu Sasaki (Honda), Tatsuki Suzuki (Honda) en Kaito Toba (Honda) was het slechte nieuws nog slechter: twaalf plekken terug. 

Op de natte omloop was Romano Fenati (Honda) in de warm-up vaak bovenaan de tijdenlijst te vinden. De vijfde man op de startopstelling kwam in zijn achtste en laatste omloop tot 1.58.672. Martin werd tweede op 0.224, Nakarin Atiratphuvapat (Honda) volgde in derde stelling. 

Achter Suzuki en Aron Canet (Honda) was er een zesde plek voor Bastianini. Ook John McPhee (Honda), Mir, Nicolo Bulega (KTM) en Marcos Ramirez (KTM) kwamen in de top-tien. Bo Bendsneyder (KTM), door de straffen zevende op de grid, sloot af op P17.

De sessie kende een groot aantal valpartijen. De ongelukkigen: Canet, Migno, Toba, Ramirez, Arbolino, Gabriel Rodrigo (KTM), Marco Bezzecchi (Mahindra) en Maria Herrera (KTM). Behalve Herrera (gebroken sleutelbeen) bleef iedereen ongedeerd.

Livio Loi (Honda) was afwezig en doet ook niet mee aan de race. De sympathieke Belg brak zaterdag bij een zware crash in de kwalificatie zijn sleutelbeen. Hij verwacht ook de Grand Prix van Aragon te moeten missen.

	Rijder	Motor	Ronden	Tijd	Verschil
1	Romano Fenati	Honda	8	1'58.672
2	Jorge Martin	Honda	8	1'58.896	0.224
3	Nakarin Atiratphuvapat	Honda	7	1'59.109	0.437
4	Tatsuki Suzuki	Honda	10	1'59.413	0.741
5	Aron Canet	Honda	8	1'59.600	0.928
6	Enea Bastianini	Honda	9	1'59.651	0.979
7	John McPhee	Honda	8	1'59.841	1.169
8	Joan Mir	Honda	10	1'59.918	1.246
9	Nicolo Bulega	KTM	10	1'59.966	1.294
10	Marcos Ramírez	KTM	8	2'00.131	1.459
11	Fabio Giannantonio	Honda	8	2'00.176	1.504
12	Philipp Ottl	KTM	10	2'00.228	1.556
13	Marco Bezzecchi	Mahindra	7	2'00.253	1.581
14	Jules Danilo	Honda	9	2'00.507	1.835
15	Juanfran Guevara	KTM	9	2'00.910	2.238
16	Niccolò Antonelli	KTM	9	2'01.199	2.527
17	Bo Bendsneyder	KTM	9	2'01.267	2.595
18	Jakub Kornfeil	Peugeot	10	2'01.399	2.727
19	Adam Norrodin	Honda	9	2'01.527	2.855
20	Jaume Masia	KTM	8	2'02.368	3.696
21	Ayumu Sasaki	Honda	9	2'02.483	3.811
22	Gabriel Rodrigo	KTM	3	2'02.530	3.858
23	Maria Herrera	KTM	8	2'02.548	3.876
24	Andrea Migno	KTM	5	2'02.902	4.230
25	Lorenzo Porta	Mahindra	9	2'03.345	4.673
26	Manuel Pagliani	Mahindra	9	2'03.351	4.679
27	Alex Fabri	Mahindra	7	2'03.476	4.804
28	Patrik Pulkkinen	Peugeot	3	2'04.078	5.406
29	Tony Arbolino	Honda	4	2'04.152	5.480
30	Kaito Toba	Honda	5	2'04.206	5.534
31	Kevin Zannoni	KTM	6	2'04.927	6.255
	Livio Loi	Honda	0
	Albert Arenas	Mahindra	0