McPhee (Honda) nam in zijn vierde ronde de eerste plek in met 2.09.527. Gresini-coureur Di Giannantonio (Honda) antwoordde even later met 2.09.309, maar McPhee bleek vlak voor het einde nog wat sneller te kunnen rondgaan. Met 2.09.080 was de piloot van het British Talent Team, slechts negentiende op de grid, twee tienden rapper.

Rodrigo (KTM), die zondag voor het eerst van pole mag vertrekken, werd op een halve seconde derde. Bendsneyder (KTM) ging op het laatste moment naar P4, met 0.095 achterstand op Rodrigo. Teamgenoot Niccolo Antonelli completeerde de top-vijf.

De twee andere rijders op de voorste startlijn, Romano Fenati (Honda) en Juanfran Guevara (KTM), waren respectievelijk elfde en 27e. WK-leider Joan Mir (Honda) klokte de negentiende tijd. De Spanjaard is vierde in de startvolgorde. Zijn Belgische ploegmakker Livio Loi was zeventiende in de warm-up. Hij neemt op Brno de negende startpositie in.

Uitslag Warm-up:

	Rijder	Motor	Ronden	Tijd	Verschil
1	John McPhee	Honda	9	2'09.080
2	Fabio Giannantonio	Honda	9	2'09.309	0.229
3	Gabriel Rodrigo	KTM	9	2'09.611	0.531
4	Bo Bendsneyder	KTM	9	2'09.706	0.626
5	Niccolò Antonelli	KTM	9	2'09.718	0.638
6	Andrea Migno	KTM	9	2'09.747	0.667
7	Marcos Ramírez	KTM	9	2'09.775	0.695
8	Maria Herrera	KTM	9	2'09.831	0.751
9	Philipp Ottl	KTM	9	2'09.846	0.766
10	Jules Danilo	Honda	9	2'09.887	0.807
11	Romano Fenati	Honda	9	2'09.923	0.843
12	Nicolo Bulega	KTM	8	2'09.963	0.883
13	Lorenzo Porta	Mahindra	9	2'10.006	0.926
14	Enea Bastianini	Honda	9	2'10.074	0.994
15	Ayumu Sasaki	Honda	9	2'10.123	1.043
16	Manuel Pagliani	Mahindra	9	2'10.185	1.105
17	Livio Loi	Honda	8	2'10.233	1.153
18	Nakarin Atiratphuvapat	Honda	9	2'10.250	1.170
19	Joan Mir	Honda	8	2'10.364	1.284
20	Kaito Toba	Honda	9	2'10.373	1.293
21	Marco Bezzecchi	Mahindra	9	2'10.415	1.335
22	Albert Arenas	Mahindra	7	2'10.435	1.355
23	Dennis Foggia	KTM	9	2'10.612	1.532
24	Jakub Kornfeil	Peugeot	9	2'10.660	1.580
25	Adam Norrodin	Honda	7	2'10.723	1.643
26	Tony Arbolino	Honda	9	2'10.808	1.728
27	Juanfran Guevara	KTM	7	2'10.813	1.733
28	Aron Canet	Honda	8	2'10.824	1.744
29	Tatsuki Suzuki	Honda	9	2'10.982	1.902
30	Patrik Pulkkinen	Peugeot	9	2'12.079	2.999
31	Tim Georgi	KTM	7	2'13.113	4.033
32	Gabriel Martínez-Abrego	KTM	8	2'14.134	5.054